玛丽蒙特修道院学校隶属于善牧修会。善牧修女会是一个国际修会，拥有 6,000 多名修女，由圣玛丽·尤弗拉西亚·佩尔蒂埃于 1835 年在法国创立。

1939 年，首批好牧人传教士在 Ligouri Burke 修女的带领下抵达新加坡。1945 年日治时期，他们在 Kampong Java 路租来的房子里开办了一所女子小学。为了满足增加入学人数的需求，学校需要更大的场地，因此于 1947 年签订了汤姆森路土地的租约。Ligouri 修女渴望为女孩提供全面优质的教育，她与 Ee Peng Liang 博士一起不懈努力，建立了玛利蒙特修道院学校。1958 年，学校正式开办，由 Maurice O'Neil 修女担任首任校长。

1995 年 12 月，中学部关闭，学校继续作为小学运营。随后，学校开始重建计划。1996 年 12 月，学校搬迁至临时校舍，并于 1999 年 6 月 28 日迁回位于玛丽蒙特路 20 号的原址，搬进一栋新建筑。该校舍于 2001 年 4 月 24 日正式开放。

2015 年至 2016 年，学校在 PERI 计划下再次升级。并于 2016 年 12 月返回其现址的升级校园。学校于 2017 年庆祝了成立 60 周年。